בית המשפט הצבאי סאלם, בשמו הרשמי בית המשפט הצבאי שומרון, נמצא בצידה ''הישראלי'' של גדר ההפרדה, מול הכפר הערבי-ישראלי סאלם.
במתחם בית המשפט נמצאת גם מינהלת התיאום והקישור של המינהל האזרחי של משרד הביטחון , מת"ק סאלם, או מת"ק ג''נין.
מן הצד הישראלי יש כניסה נפרדת למת''''ק וכניסה נפרדת לבית המשפט, בה משתמשים אנשי הצבא ועורכי הדין אזרחי ישראל.
בצד הפלסטיני יש כניסה למת''''ק וכניסה לבית המשפט בה משתמשים עורכי הדין הפלסטינים, קרובי משפחה של העצירים וגם נציגי ארגונים כמו שלנו.
במסלול הבידוק למתחם בית המשפט נוצר לעיתים דוחק רב.
בעבר היה שם מחסום שעברו בו חקלאים ואחרים. כיום, בעונת המסיק בלבד, מאפשרים לחקלאים מהכפר זובובא להגיע אל אדמותיהם דרך מחסום זה. גדר ההפרדה נתקה את החקלאים מאדמתם.
אולמות בית המשפט מסודרים וממוזגים.
חדר ההמתנה של המשפחות, של עורכי הדין הפלסטינים ושל נציגי הארגונים מסודר בצורה סבירה. בקרבתו מתקן שתייה ושירותים. אין מזנון.
סדר המשפטים המתנהלים בבית המשפט בסאלם אינו מפורסם מראש. לא ידוע גם מועד ההתנהלות של כל משפט. כתוצא מכך, ההמתנה לעיתים ארוכה: ממתינים לקריאה למשפחה להיכנס לאולם. הממתינים  מצטופפים ליד שער הכניסה מאזור ההמתנה לאזור אולמות המשפט כדי לשמוע היטב את הקריאה למשפט שלהם.
חדרי אנשי הצבא ועורכי הדין אזרחי ישראל נמצאים מהצד השני של הביתנים של אולמות המשפט.
 
התנאים הפיזיים לא מהווים הקושי העיקרי במקום, הנושאים הנדונים בו ועצם קיומו של בית המשפט הצבאי לאוכלוסיה אזרחית, הוא הבעיה העיקרית שמקורה בעצם הכיבוש.